Helgenomsekvensering av 52 stammer av Chlamydia trachomatis viser større grad av rekombinasjon mellom stammene enn tidligere antatt.
Sirkulær fremstilling av Chlamydia trachomatis-genomet. Foto Science Photo/ NTB scanpix
Chlamydia trachomatis er den vanligste årsaken til seksuelt overførbare infeksjoner globalt og infeksjonsbetinget blindhet i utviklingsland. Utveksling av DNA (rekombinasjon) mellom stammer av C trachomatis har vært ansett som sjeldent forekommende, ettersom dette krever infeksjon av to stammer i samme vert. I flere tiår ble antistoffer mot overflateproteinet ompA og sekvensering av ompA benyttet ved genotyping av klamydia.
I en ny studie har forskere sett på hele genomsekvensen til 52 C. trachomatis-stammer og funnet betydelig grad av rekombinasjon (1). Basert på helgenomsekvensering skisserer forfatterne et nytt fylogenetisk tre for chlamydia som avviker fra ompA-baserte trær. Chlamydiagenomet har tidligere vært oppfattet som stabilt, kondensert og med lite DNA-utveksling mellom ulike stammer, men forskerne påviser stor grad av rekombinasjon.
– Helgenomsekvensering avspeiler «sann» chlamydiaevolusjon og kan erstatte bruk av surrogatmarkører i genotyping, sier Kirsten Gravningen, stipendiat og overlege ved Avdeling for mikrobiologi og smittevern, Universitetssykehuset Nord-Norge. Frem til nå har genotyping stort sett vært benyttet i vitenskapelige studier, for eksempel i analyse av seksuelle nettverk og ved klonale utbrudd. I fremtiden kan neste generasjon sekvensteknologi gjøre helgenomsekvensering aktuelt ved partneroppsporing, behandlingssvikt og differensiering mellom residiverende og kroniske infeksjoner, sier Gravningen.
